Část smlouvy s Vatikánem je v rozporu s českým ústavním pořádkem, rozhodl Ústavní soud. Ratifikaci tak nelze dokončit, dokud se rozpor neodstraní, například dalším jednáním obou smluvních stran. Problematickými body jsou podle nálezu soudu zpovědní tajemství a přístup k církevním archivům.